Chef de Projet Système d’Information Cohortes - Programme RaDiCo
Ile de France, Paris (75000) - Référence : CPC SI RADICO
Mis en ligne le 11 avril 2014 par radico (+ d'offres)
Inserm Programme RaDiCo
Type de contrat :CDD
Métier :Responsable de projet fonctionnel
Type d'entreprise :Autre type d'entreprise (client final)
Localisation :Ile de France, Paris (75000)
Salaire :De 35K€ à 40K€ selon profil et expérience
Télétravail :Pas de télétravail
Compétences requises :Administration de base de données, Gestion de projet, Modélisation des bases de données, Théorie des langages, Web sémantique
Poste à pourvoir
MISSION ET OBJECTIFS
Sous la direction du responsable de recherche en systèmes d’information, au sein du pôle de recherche SI composé de 4 à 6 personnes, le chef de projet est chargé de lancer les développements des programmes informatiques de gestion des cohortes et de les suivre jusqu’à bonne marche. Il interface avec le pôle de Recherche Clinique (RC) et les développeurs de RaDiCo.
Missions principales :
• Il analyse les besoins fonctionnels de l’utilisateur final et/ou du clinicien qui commande le logiciel. Il rédige donc le cahier des besoins fonctionnels et techniques en premier livrable. Ce cahier est la traduction des besoins fonctionnels en besoins techniques. La partie « data des e-CRF » est faite en collaboration avec les chefs de projets cohortes du pôle de recherche clinique.
• Il fournit une indication de ressources temps x hommes à allouer à l’équipe Ingénierie pour cette commande. Il livre une estimation, qui l’engage, de ressources en livrable #2, nécessaire à la validation avant toute consommation de ressources de développement.
• Après validation des parties prenantes (Pôle RC, Pôle SI, Direction), il assure le suivi de son portefeuille de projets de cohortes dans le respect des ressources temps/coûts agréés. Il rédige les spécifications détaillées avec les développeurs en livrables #3 (Use Cases et User Stories) puis suit au quotidien les développeurs pour répondre à leurs questions lors de l’écriture du code. Il interface avec le Pole RC dans tous les échanges entre pôles SI et RC pour parfaire la construction des logiciels, optimiser leurs intégrations en opération et les maintenir au cours du cycle de vie supporté.
• En fin de développement il assure la recette du livrable : il exécute les tests fonctionnels et pilote les corrections nécessaires en collaboration avec le pôle de recherche clinique et les développeurs.
• Il implémente les outils de suivi des développements en méthodes AGIL (GIRA, Green Hopper, Kanban…)
Rattachement / Liens Hiérarchiques :
Rattachement auprès du Responsable du pôle de recherche en systèmes d’information de RaDiCo
Sous la direction du responsable de recherche en systèmes d’information, au sein du pôle de recherche SI composé de 4 à 6 personnes, le chef de projet est chargé de lancer les développements des programmes informatiques de gestion des cohortes et de les suivre jusqu’à bonne marche. Il interface avec le pôle de Recherche Clinique (RC) et les développeurs de RaDiCo.
Missions principales :
• Il analyse les besoins fonctionnels de l’utilisateur final et/ou du clinicien qui commande le logiciel. Il rédige donc le cahier des besoins fonctionnels et techniques en premier livrable. Ce cahier est la traduction des besoins fonctionnels en besoins techniques. La partie « data des e-CRF » est faite en collaboration avec les chefs de projets cohortes du pôle de recherche clinique.
• Il fournit une indication de ressources temps x hommes à allouer à l’équipe Ingénierie pour cette commande. Il livre une estimation, qui l’engage, de ressources en livrable #2, nécessaire à la validation avant toute consommation de ressources de développement.
• Après validation des parties prenantes (Pôle RC, Pôle SI, Direction), il assure le suivi de son portefeuille de projets de cohortes dans le respect des ressources temps/coûts agréés. Il rédige les spécifications détaillées avec les développeurs en livrables #3 (Use Cases et User Stories) puis suit au quotidien les développeurs pour répondre à leurs questions lors de l’écriture du code. Il interface avec le Pole RC dans tous les échanges entre pôles SI et RC pour parfaire la construction des logiciels, optimiser leurs intégrations en opération et les maintenir au cours du cycle de vie supporté.
• En fin de développement il assure la recette du livrable : il exécute les tests fonctionnels et pilote les corrections nécessaires en collaboration avec le pôle de recherche clinique et les développeurs.
• Il implémente les outils de suivi des développements en méthodes AGIL (GIRA, Green Hopper, Kanban…)
Rattachement / Liens Hiérarchiques :
Rattachement auprès du Responsable du pôle de recherche en systèmes d’information de RaDiCo
Profil recherché
Formation :
- Formation d'ingénieur avec formation au suivi de projet sur les outils modernes de planification et d’état des suivis projets dans le Cloud.
- Bac +5 (type Master ou Ecole d’Ingénieur) ou Doctorat.
Expérience :
- Gestion de projet pendant au minimum 5 ans en environnement AGILE pour du développement applicatif en mode SaaS/cloud computing. Idéalement cette expérience de gestion de projet comprendra 2 ans en environnement médical de recherche clinique (CRF / e-CRF) ou au moins scientifique.
- Un passé de développeur sera apprécié. Pilotage de portefeuille de projets multiples s’étendant sur plusieurs mois est nécessaire.
Compétences requises :
- Bonnes connaissances des modèles et outils de collecte de données de santé
- Très bonnes connaissances des services webs et des architectures orientées services
- Bonnes connaissances des architectures de données ouvertes ou liées
- Bonnes connaissances des standards du web sémantique
- Très bonnes connaissances d’outils pour la gestion de données (MDM, ETL, EAI)
- Aptitudes pour la programmation
- A l’aise avec les langages (RDF, SKOS, OWL, OBO, etc.)
- Anglais lu, parlé et écrit
Qualités requises :
- Sens de l’écoute, du service à l’utilisateur, rigueur, objectivité et sens pratique
- Qualité rédactionnel d’un analyste
- Curiosité pour les sciences du vivant et l’innovation médicale,
- Anglais courant, écrit et oral (RaDiCo doit s'ouvrir à l'international),
- Forte capacité d’adaptation, dans une structure à évolution rapide,
- Très bonnes qualités d’analyse, de synthèse et d’anticipation des difficultés
- Formation d'ingénieur avec formation au suivi de projet sur les outils modernes de planification et d’état des suivis projets dans le Cloud.
- Bac +5 (type Master ou Ecole d’Ingénieur) ou Doctorat.
Expérience :
- Gestion de projet pendant au minimum 5 ans en environnement AGILE pour du développement applicatif en mode SaaS/cloud computing. Idéalement cette expérience de gestion de projet comprendra 2 ans en environnement médical de recherche clinique (CRF / e-CRF) ou au moins scientifique.
- Un passé de développeur sera apprécié. Pilotage de portefeuille de projets multiples s’étendant sur plusieurs mois est nécessaire.
Compétences requises :
- Bonnes connaissances des modèles et outils de collecte de données de santé
- Très bonnes connaissances des services webs et des architectures orientées services
- Bonnes connaissances des architectures de données ouvertes ou liées
- Bonnes connaissances des standards du web sémantique
- Très bonnes connaissances d’outils pour la gestion de données (MDM, ETL, EAI)
- Aptitudes pour la programmation
- A l’aise avec les langages (RDF, SKOS, OWL, OBO, etc.)
- Anglais lu, parlé et écrit
Qualités requises :
- Sens de l’écoute, du service à l’utilisateur, rigueur, objectivité et sens pratique
- Qualité rédactionnel d’un analyste
- Curiosité pour les sciences du vivant et l’innovation médicale,
- Anglais courant, écrit et oral (RaDiCo doit s'ouvrir à l'international),
- Forte capacité d’adaptation, dans une structure à évolution rapide,
- Très bonnes qualités d’analyse, de synthèse et d’anticipation des difficultés
Description de la société
CONTEXTE
RaDiCo (Rare Disease Cohorts)
Le programme RaDiCo est financé par le Ministère de la Recherche pour 10 ans à hauteur de 10 072 118 € dans le cadre de l’appel à projets « Cohortes » des investissements d'avenir gérés par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR). Il vise à développer une plate-forme commune pour le suivi des cohortes maladies rares en France. Cet appel à projets « Cohortes » visait à doter la France de grands instruments épidémiologiques pour mieux comprendre les déterminants de la santé, optimiser les pratiques médicales et les politiques de santé publique.
RaDiCo, coordonné par l’Inserm, s’appuie sur le réseau des 131 centres de référence maladies rares (CRMR) et des 501 centres de compétence (CCMR) couvrant 23 groupes de maladies rares (filières), sur 54 laboratoires hospitalo-universitaires de diagnostic moléculaire, sur des centres de ressources biologiques, des laboratoires de recherche et des registres de maladies rares, ainsi que sur les associations de patients.
Les défis à relever sont liés à la dispersion des très nombreuses équipes concernées (soins et recherche, organismes de tutelle nombreux), à l’hétérogénéité des moyens alloués selon les maladies rares, et à l’hétérogénéité des systèmes d’information existants (cliniques et biologiques).
L’objectif principal de RaDiCo est le recueil prospectif de données phénotypiques extensives à des fins de recherche clinique et épidémiologique en lien avec la recherche fondamentale et translationnelle. Le phénotype est l'ensemble des caractères observables d'un individu. On appelle aussi cet ensemble le phénome. Ces données sont diverses : anatomiques, morphologiques, physiologiques, biochimiques, radiologiques, moléculaires, etc.
Les objectifs secondaires de RaDiCo sont d’établir des corrélations phénotype/génotype, de progresser dans la connaissance des mécanismes physiopathologiques, et de valider/découvrir de nouvelles pistes thérapeutiques en lien avec les partenaires industriels.
Ces données seront exploitées en concertation avec tous les acteurs impliqués : équipes soignantes, partenaires institutionnels, équipes de recherche, associations de patients ou partenaires industriels. Elles seront traitées conformément au protocole défini pour chaque cohorte. Elles permettront de :
- formuler des recommandations de prise en charge ;
- fournir des indicateurs de santé publique : facteurs de risque, incidence des maladies (nouveaux cas), degré de sévérité, de handicap, mortalité ;
- structurer les programmes de recherche destinés à améliorer les connaissances sur les maladies rares en lien avec les équipes scientifiques ;
- élaborer des recommandations pour améliorer le diagnostic et la prise en charge des patients ;
- orienter le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques en lien avec les partenaires industriels ;
- améliorer les connaissances socioéconomiques pour une meilleure organisation de l’offre de soins.
Les données à traiter dans le cadre du programme RaDiCo sont très hétérogènes et nécessitent de nouvelles approches de traitement de l’information biomédicale. Un pôle de recherche en systèmes d’information, composé d’experts en informatique médicale et en sémantique aura la charge de développer les méthodes et les outils de demain afin de faciliter le traitement des données et des connaissances dans le domaine des maladies rares en coordination avec l’équipe BNDMR (Banque Nationale de Données Maladies Rares). Les missions de cette équipe sont les suivantes :
• La mise en œuvre d’outils de gestion de catalogues de métadonnées facilitant la mise en œuvre d’eCRF (bordereaux électroniques de recueil d’information)
• Faciliter l’interopérabilité des bases de données existantes (imagerie, génétique, cliniques) par la mise en œuvre de nouveaux modes de traitement de l’information (webservices, RFD, opendata), et construire des connecteurs entre bases existantes dans les hôpitaux
• Modéliser et mettre en œuvre des ontologies facilitant la contextualisation de l’information traitée suivant les spécialités médicales en s’appuyant sur les bases de connaissances disponibles (Orphanet, HPO, EBI, BioPortal, etc.)
• Développement et mise en œuvre de nouvelles approches d’alignement d’ontologies
L’équipe du Pôle de recherche SI sera en lien étroit avec l’équipe du Pôle de recherche clinique de RaDiCo qui a la mission de mettre en œuvre l'utilisation des outils du système d’information dans les Centres de Référence Maladies Rares impliqués, lors de l'implémentation puis de la gestion des études cliniques de cohortes RaDiCo.
Site web : www.radico.fr
RaDiCo (Rare Disease Cohorts)
Le programme RaDiCo est financé par le Ministère de la Recherche pour 10 ans à hauteur de 10 072 118 € dans le cadre de l’appel à projets « Cohortes » des investissements d'avenir gérés par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR). Il vise à développer une plate-forme commune pour le suivi des cohortes maladies rares en France. Cet appel à projets « Cohortes » visait à doter la France de grands instruments épidémiologiques pour mieux comprendre les déterminants de la santé, optimiser les pratiques médicales et les politiques de santé publique.
RaDiCo, coordonné par l’Inserm, s’appuie sur le réseau des 131 centres de référence maladies rares (CRMR) et des 501 centres de compétence (CCMR) couvrant 23 groupes de maladies rares (filières), sur 54 laboratoires hospitalo-universitaires de diagnostic moléculaire, sur des centres de ressources biologiques, des laboratoires de recherche et des registres de maladies rares, ainsi que sur les associations de patients.
Les défis à relever sont liés à la dispersion des très nombreuses équipes concernées (soins et recherche, organismes de tutelle nombreux), à l’hétérogénéité des moyens alloués selon les maladies rares, et à l’hétérogénéité des systèmes d’information existants (cliniques et biologiques).
L’objectif principal de RaDiCo est le recueil prospectif de données phénotypiques extensives à des fins de recherche clinique et épidémiologique en lien avec la recherche fondamentale et translationnelle. Le phénotype est l'ensemble des caractères observables d'un individu. On appelle aussi cet ensemble le phénome. Ces données sont diverses : anatomiques, morphologiques, physiologiques, biochimiques, radiologiques, moléculaires, etc.
Les objectifs secondaires de RaDiCo sont d’établir des corrélations phénotype/génotype, de progresser dans la connaissance des mécanismes physiopathologiques, et de valider/découvrir de nouvelles pistes thérapeutiques en lien avec les partenaires industriels.
Ces données seront exploitées en concertation avec tous les acteurs impliqués : équipes soignantes, partenaires institutionnels, équipes de recherche, associations de patients ou partenaires industriels. Elles seront traitées conformément au protocole défini pour chaque cohorte. Elles permettront de :
- formuler des recommandations de prise en charge ;
- fournir des indicateurs de santé publique : facteurs de risque, incidence des maladies (nouveaux cas), degré de sévérité, de handicap, mortalité ;
- structurer les programmes de recherche destinés à améliorer les connaissances sur les maladies rares en lien avec les équipes scientifiques ;
- élaborer des recommandations pour améliorer le diagnostic et la prise en charge des patients ;
- orienter le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques en lien avec les partenaires industriels ;
- améliorer les connaissances socioéconomiques pour une meilleure organisation de l’offre de soins.
Les données à traiter dans le cadre du programme RaDiCo sont très hétérogènes et nécessitent de nouvelles approches de traitement de l’information biomédicale. Un pôle de recherche en systèmes d’information, composé d’experts en informatique médicale et en sémantique aura la charge de développer les méthodes et les outils de demain afin de faciliter le traitement des données et des connaissances dans le domaine des maladies rares en coordination avec l’équipe BNDMR (Banque Nationale de Données Maladies Rares). Les missions de cette équipe sont les suivantes :
• La mise en œuvre d’outils de gestion de catalogues de métadonnées facilitant la mise en œuvre d’eCRF (bordereaux électroniques de recueil d’information)
• Faciliter l’interopérabilité des bases de données existantes (imagerie, génétique, cliniques) par la mise en œuvre de nouveaux modes de traitement de l’information (webservices, RFD, opendata), et construire des connecteurs entre bases existantes dans les hôpitaux
• Modéliser et mettre en œuvre des ontologies facilitant la contextualisation de l’information traitée suivant les spécialités médicales en s’appuyant sur les bases de connaissances disponibles (Orphanet, HPO, EBI, BioPortal, etc.)
• Développement et mise en œuvre de nouvelles approches d’alignement d’ontologies
L’équipe du Pôle de recherche SI sera en lien étroit avec l’équipe du Pôle de recherche clinique de RaDiCo qui a la mission de mettre en œuvre l'utilisation des outils du système d’information dans les Centres de Référence Maladies Rares impliqués, lors de l'implémentation puis de la gestion des études cliniques de cohortes RaDiCo.
Site web : www.radico.fr