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Traduction modèles d'influences - modèles méca

Ile de France, Vélizy, DS SE Campus - Référence : 309520 15173277
Mis en ligne le 2 septembre 2016 par dassault (+ d'offres)
Dassault Systèmes SE
Type de contrat :Stage
Métier :Responsable des études
Type d'entreprise :Autre type d'entreprise (client final)
Localisation :Ile de France, Vélizy, DS SE Campus
Salaire :de 6 000 €/an à 12 000 €/an
Compétences requises :C++, CSS, HTML5, Javascript, Perl, Python
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Poste à pourvoir

L'équipe de « BioSystems Modeling&Simulation» au sein du groupe « Integrative Therapeutics » de la marque BIOVIA, développe des applications destinées aux acteurs de l'industrie pharmaceutique. Ces applications mobilisent la modélisation et la simulation in silico de systèmes biologiques afin de d'étudier les modes d'actions des molécules thérapeutiques, d'optimiser les options thérapeutiques pour les patients et d'aider à prioriser des cibles potentielles. Les systèmes biologiques intra- et intercellulaire décrivent les interactions moléculaires qui permettent aux cellules de produire de l'énergie et le matériel dont elles sont constituées, ainsi que d'influencer leurs comportements. Ces systèmes peuvent être modélisés à différents niveaux d'abstraction et de précision. Durant ce stage nous nous intéressons à l'interconnexion entre deux niveaux : i) le niveau « influences fonctionnelles » qui décrit le flux d'information et les liens causes - effets et ii) le niveau « mécanistique » qui décrit le flux de matière à travers des transformations biochimiques de molécules et qui décrit les détails des modes d'action des influences.Votre mission sera de travailler sur un algorithme semi-automatique aidant l'utilisateur à construire un modèle « mécanistique » à partir d'un modèle « d'influences ».Alternativement, vous pourrez également travailler sur la traduction inverse qui générera de manière semi-automatique une vue « influence » pour un modèle « mécanistique ». Votre travail consistera à identifier et à expliciter des informations nécessaires pour effectuer cette traduction, la classification et la généralisation des cas de traductions automatiques possibles et appliquer ces méthodes afin de les tester sur les modèles disponibles dans les bases de données de pathways tel que Reactome, BioModels et le Cancer Cell Atlas.L'ensemble des travaux algorithmiques doit se concrétiser dans un prototype.

Profil recherché

Etudiant(e) en Ecole d'Ingénieurs ou Master universitaire, vous préparez un diplôme de niveau Bac+4 ou Bac+5.
Vous vous spécialisez en informatique, bioinformatique.
Excellentes connaissances en algorithmique, programmation objet en C++ et/ou la programmation web (javascript, HTML5, CSS) et êtes à l'aise dans la manipulation informatique de données complexes. La connaissance d'un langage de scripting (python, perl ou autre) serait utile pour les tests rapides.
Des connaissances en biologie moléculaire ne sont pas nécessaires mais vous serez amené(e) à vous former sur les concepts biologiques importants pour comprendre le besoin utilisateur.
Autonomie, capacité d'adaptation vous aiderons à mener à bien cette mission.

Description de la société

Dassault Systèmes, « The 3DEXPERIENCE Company », offre aux entreprises et aux particuliers les univers virtuels nécessaires à la conception d'innovations durables. Ses solutions leaders sur le marché transforment pour ses clients, la conception, la fabrication et la maintenance de leurs produits. Les solutions collaboratives de Dassault Systèmes permettent de promouvoir l'innovation sociale et offrent de nouvelles possibilités d'améliorer le monde  réel grâce aux univers virtuels. Avec des ventes dans plus de 140 pays, le Groupe apporte de la valeur à plus de 200 000 entreprises de toutes tailles dans toutes les industries. Pour plus d'informations : www.3ds.com.   

CATIA, SOLIDWORKS, SIMULIA, DELMIA, ENOVIA, GEOVIA, EXALEAD, BIOVIA, NETVIBES, 3D VIA, 3DEXCITE sont des marques déposées de Dassault Systèmes ou de ses filiales aux USA et/ou dans d'autres pays.

Site web : http://www.dassault.fr/

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