Ingénieur de développement : application web pour analyser des données temporelles de gènes rapporte

Titre du poste: Ingénieur de développement : Application web pour analyser des données temporelles de gènes rapporteurs fluorescents H/F

Thème de recherche : Santé, biologie et planète numériques
Projet : IBIS

Mission
Les rapporteurs fluorescents sont devenus un outil expérimental populaire pour suivre l’expression génique in vivo. Ceci génère de grandes quantités de données dont l’analyse demande des outils bioinformatiques adaptés. Récemment, une méthode pour reconstruire des activités de promoteur et des concentrations protéiques à partir de données brutes de fluorescence a été développée dans l’équipe-projet IBIS à l’INRIA Grenoble – Rhône-Alpes et implémentée dans l’outil WellInverter.

Descriptif du poste
Dans le cadre de l’appel d’offre “Développement de services bio-informatiques pour les sciences de la vie” de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB) [2], nous cherchons un ingénieur de développement pour transformer WellInverter en une application web fiable et facile à utiliser pour les biologistes, hébergée sur une plate-forme de l’IFB. Plus précisément, les tâches de développement incluent :

- Optimiser les algorithmes (Python) pour garantir une qualité de service ;
- Mettre en place une architecture distribuée pour répartir les calculs sur différentes machines ;
- Améliorer l’interface utilisateur graphique (JavaScript, Ajax) ;
- Ajouter des fonctionnalités au logiciel existant.

Profil recherché
Nous cherchons un ingénieur de développement (niveau bac+5), pour un CDD d’un an, avec les compétences suivantes :

- Bonne connaissance de la programmation en Python, et notamment des librairies de calcul scientifique Numpy et Scipy ;
- Bonne connaissance des architectures web et du développement d’interface homme-machine (HTML, CSS, JavaScript, Ajax) ;
- Bon relationnel, qualité d’écoute et d’analyse ;
- Autonomie.

Des connaissances en biologie ne sont pas indispensables pour mener à bien le projet proposé.

Avantages
- Participation Inria aux frais de restauration et aux frais de transport domicile/lieu de travail

Informations complémentaires
Merci de postuler directement en envoyant votre CV et votre lettre de motivation à hidde.de-Jong@inria.fr.
Date de prise de fonction souhaitée : flexible du 01/06/2016 au 31/12/2016 au plus tard

A propos d'Inria et du poste
Inria, institut de recherche dédié au numérique, promeut « l'excellence scientifique au service du transfert technologique et de la société ». Inria emploie 2700 collaborateurs issus des meilleures universités mondiales, qui relèvent les défis des sciences informatiques et mathématiques. Son modèle ouvert et agile lui permet d’explorer des voies originales avec ses partenaires industriels et académiques. Inria répond ainsi efficacement aux enjeux pluridisciplinaires et applicatifs de la transition numérique. Inria est à l'origine de nombreuses innovations créatrices de valeur et d'emplois.

Les objectifs de l'équipe IBIS génèrent quatre défis principaux à l'interface de la biologie (expérimentale), les mathématiques appliquées et l'informatique. Plus particulièrement, le programme de recherche se base sur :
- l'analyse de la dynamique qualitative de réseaux de régulation génique,
- l'inférence de réseaux de régulation génique à partir de données temporelles,
- l'analyse de réseaux métaboliques et géniques intégrés,
- la ré-ingénierie de réseaux de régulation.

Site web : http://www.inria.fr/