Un(e) Post Doctorant(e) Statistiques /Learning Machine (H/F)
Ile de France, Paris (75000) - Référence : POSTDOCSTAT 12263547
Mis en ligne le 7 janvier 2016 par IHU-A-ICM (+ d'offres)
ICM
Type de contrat :CDD
Métier :PostDoc
Type d'entreprise :Autre type d'entreprise (client final)
Localisation :Ile de France, Paris (75000)
Salaire :de 30 000 €/an à 35 000 €/an
Compétences requises :machine learning, Statistiques
Poste à pourvoir
Afin d'évaluer l'efficacité d'un traitement thérapeutique dans le cadre d'un essai clinique sur l'ataxie spinocérébelleuse (SCA), l'identification de biomarqueurs multimodaux appropriés est cruciale. L'hypothèse formulée est que la modification de la structure et de l'activité cérébrale résulte de traits génétiques portant sur l'expression des gènes ou les fonctions métaboliques. Dans ce contexte, une cohorte de 67 patients atteints et de 35 témoins sains a été suivie. Pour chaque participant, des données de nature variée ont été collectées lors de deux visites, et leur analyse conjointe nécessite le développement d'une méthodologie statistique adaptée. Les données obtenues pour chaque patient de la cohorte proviennent de sources différentes. Elles fournissent une description de la maladie sous des angles complémentaires, soulignant la nécessité d'algorithmes spécifiques pour combiner ces différents points de vue.
Ces développements devront reposer sur des avancées méthodologiques significatives dans le domaine de la statistique en raison de :
1/ la complexité et l'hétérogénéité des différents types de données considérés,
2/ la dimension des données génomiques et de neuro-imagerie, qui requiert de pouvoir associer des milliards de variables entre elles. Un accent particulier sera mis sur la visualisation de données, afin d'améliorer l'interprétation des résultats obtenus. Toutes les données de la cohorte SCA sont centralisées au niveau de la plate-forme de Bio-informatique/Biostatistique de l'ICM, qui bénéficie de l'expertise de chercheurs/ingénieurs dans les domaines de la génomique, de la neuro-imagerie et de la statistique.
Toutes les analyses pourront être menées sur la base de méthodes récemment publiées [Tenenhaus et al 2015, Lofstedt et al 2015, Tenenhaus & Tenenhaus 2014A, Tenenhaus et al 2014b, Tenenhaus & Tenenhaus 2011]. Les outils méthodologiques développés durant ce projet seront intégrés dans un logiciel prototype (par exemple sous la forme d'un package R).
Ces développements devront reposer sur des avancées méthodologiques significatives dans le domaine de la statistique en raison de :
1/ la complexité et l'hétérogénéité des différents types de données considérés,
2/ la dimension des données génomiques et de neuro-imagerie, qui requiert de pouvoir associer des milliards de variables entre elles. Un accent particulier sera mis sur la visualisation de données, afin d'améliorer l'interprétation des résultats obtenus. Toutes les données de la cohorte SCA sont centralisées au niveau de la plate-forme de Bio-informatique/Biostatistique de l'ICM, qui bénéficie de l'expertise de chercheurs/ingénieurs dans les domaines de la génomique, de la neuro-imagerie et de la statistique.
Toutes les analyses pourront être menées sur la base de méthodes récemment publiées [Tenenhaus et al 2015, Lofstedt et al 2015, Tenenhaus & Tenenhaus 2014A, Tenenhaus et al 2014b, Tenenhaus & Tenenhaus 2011]. Les outils méthodologiques développés durant ce projet seront intégrés dans un logiciel prototype (par exemple sous la forme d'un package R).
Profil recherché
*Doctorat en statistique/machine learning.
*Une expérience en analyse de données multivariées appliquée à des données biologiques et/ou en neuroimagerie sera fortement appréciée.
*Une expérience en analyse de données multivariées appliquée à des données biologiques et/ou en neuroimagerie sera fortement appréciée.
Description de la société
L'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière est une Fondation reconnue d'utilité publique en septembre 2006 dont l'objet est la recherche fondamentale et clinique sur le système nerveux. Sur un même lieu, 600 chercheurs et scientifiques couvrant l'ensemble des disciplines de la neurologie, dans le but d'accélérer les découvertes sur le fonctionnement du cerveau, et les développements de traitements sur les maladies comme : Alzheimer, Parkinson, Sclérose en plaques, épilepsie, dépression, paraplégies, tétraplégies, etc.
Site web : http://www.icm-institute.org
Site web : http://www.icm-institute.org