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Un(e) ingénieur bio-informatique (h/f)

Ile de France, Paris (75000) - Référence : INGBIOINF2015 8583046
Mis en ligne le 14 janvier 2015 par IHU-A-ICM (+ d'offres)
ICM
Type de contrat :CDD
Métier :Ingénieur développement logiciel
Type d'entreprise :Autre type d'entreprise (client final)
Localisation :Ile de France, Paris (75000)
Compétences requises :CSS, HTML, Javascript, Perl, PHP, Python, Unix
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Poste à pourvoir

MISSIONS PRINCIPALES
Le/la candidate aura pour mission le développement d'une application permettant la caractérisation et l'annotation de polymorphismes. Il/elle travaillera en collaboration avec la plate-forme de Bio-informatique / Biostatistique de l'Institut de Neurosciences Translationnelles (IHU-A-ICM).

Cette offre s'intègre au projet NEUR-I-MYEL. Ce projet a pour mission de développer des stratégies thérapeutiques innovantes pour la Sclérose en Plaques. Dans le cadre de NEUR-I-MYEL, des gènes de susceptibilité impliqués dans des processus de régulation immunitaire ont été identifiés à travers des études de polymorphismes, et caractérisés à l'aide d'un processus de curation manuel basé sur la consultation et le croisement d'informations extraites des bases de données publiques Gene Ontology, Immunological Genome Project et OMIM.

La personne recherchée travaillera à l'automatisation de cette caractérisation des polymorphismes et des gènes associés et mettra en place un outil logiciel permettant aux utilisateurs de la mettre en oeuvre de façon légère.

Profil recherché

SAVOIR-FAIRE
*Expérience souhaitée de 1 an ou plus,
SAVOIR
*Master ou diplôme d'ingénieur en informatique (génie logiciel), ou double formation biologie + informatique (niveau Master) complétée par une expérience significative en informatique.
*Maîtrise de langages de programmation (Python, Perl), de technologies de développement web (HTML, CSS, JavaScript, PHP), et de l'environnement UNIX.
*Notions de méthodes en bio-informatique et connaissance de bases de données génétiques et génomiques (HapMap, Gene Ontology, OMIM).
*Anglais technique (lu, écrit).

SAVOIR-ETRE
*Rigueur méthodologique (spécifications, documentation) et autonomie.
*Travail en équipe et en environnement multidisciplinaire.

Description de la société

L'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière est une Fondation reconnue d'utilité publique en septembre 2006 dont l'objet est la recherche fondamentale et clinique sur le système nerveux. Sur un même lieu, 600 chercheurs et scientifiques couvrant l'ensemble des disciplines de la neurologie, dans le but d'accélérer les découvertes sur le fonctionnement du cerveau, et les développements de traitements sur les maladies comme : Alzheimer, Parkinson, Sclérose en plaques, épilepsie, dépression, paraplégies, tétraplégies, etc.

Site web : http://www.icm-institute.org

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